Die Bewertungen für apotheker.com fallen durchweg positiv aus. Viele Kunden loben die sehr schnelle Lieferung, wobei Bestellungen meist innerhalb weniger Tage oder sogar am nächsten Tag eintreffen. Die Preise werden überwiegend als günstig und fair bewertet. Der Bestellprozess wird als einfach, übersichtlich und problemlos beschrieben, zudem wird die Kundenfreundlichkeit insbesondere durch den hilfsbereiten und freundlichen Kundenservice hervorgehoben. Auch die Verpackung wird meist als angemessen und sorgfältig wahrgenommen. Die Produktauswahl gilt als umfangreich und qualitativ hochwertig, wobei besonders spezielle oder nachhaltige Produkte positiv auffallen. Einige Kunden empfinden die Versandkosten jedoch als zu hoch. Es gibt vereinzelt Kritik an beschädigten Paketen durch den Versanddienst. Die Wahl und Qualität der Versanddienstleister, insbesondere GLS und DHL, wird teilweise negativ bewertet, vor allem aufgrund von Abholproblemen und beschädigten Paketen.