Die Bewertungen für apotheker.com fallen durchweg positiv aus. Die Kunden loben die sehr schnelle Lieferung und den zügigen Versand der Bestellungen. Besonders hervorgehoben werden außerdem die günstigen und fairen Preise sowie das gute Preis-Leistungs-Verhältnis. Die Verpackung wird als gut, sicher und angemessen beschrieben, und der Bestellvorgang überzeugt durch seine Unkompliziertheit und Übersichtlichkeit. Auch der freundliche, hilfsbereite und kompetente Support findet viel Anerkennung, ebenso wie kleine Geschenke, Produktproben oder informative Beilagen in den Paketen. Die Verfügbarkeit der Produkte wird im Allgemeinen positiv bewertet. Vereinzelt gibt es jedoch Kritik an beschädigten Paketen. Außerdem äußern einige Kunden Unzufriedenheit mit bestimmten Versanddienstleistern, insbesondere GLS, während DHL meist besser abschneidet. Gelegentlich kommt es zu Engpässen oder es werden Ersatzartikel geliefert.